车贷还了两年后车被抵押，还不起款项会不会被

一般不会的。民间借贷属于民事纠纷，不属于刑事案件的范畴，民事纠纷一般不会判刑。但是，如果民间借贷的债务人在人民法院的判决生效后，有能力履行而故意不履行还款义务的，有可能触犯拒不执行判决、裁定罪，这种情形就有可能会判刑。
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对于已经超过诉讼时效而未主张权利的，建议债权人不要盲目起诉，应当寻找专业人士采取补救措施，如与债务人重新达成还债协议等等。
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追讨债务，如果该债权有抵押担保或者有第三人提供担保的，债权人可与抵押人或者保证人进行协商，使抵押人以足额的抵押资产抵偿债务，或者由保证人来代偿债务。